Tal como lo establecen su misión y estatutos, la FIIAPP dedica una parte importante de sus esfuerzos a la cooperación con América Latina en el ámbito de la gobernabilidad, la promoción y consolidación de las instituciones públicas y la reforma del Estado.

Apoyando el esfuerzo de la cooperación española, la FIIAPP ha ejecutado una serie de proyectos en distintos sectores establecidos por la Agencia Española de Cooperación Internacional para el Desarrollo (AECID) en el marco de la negociación de las respectivas Comisiones Mixtas celebradas con los países de la región.

En el área de la gobernabilidad, la FIIAPP colabora con las administraciones españolas y la AECID en dos grandes proyectos, uno para América Central y otro para América del Sur, dirigidos a la formación y capacitación de funcionarios públicos en diferentes sectores tales como: Justicia, Fiscalidad, Control del Gasto Público, Desarrollo Gerencial Estratégico y Promoción de la Democracia Representativa y Participativa y del Pluralismo Político, entre otros.

Entre los diferentes proyectos que se han desarrollado en el 2006-2007 cabe subrayar, entre otros en el 2006: la creación de la Escuela Judicial en Centroamérica junto con el CGPJ, el apoyo al proyecto de concertación en Chile, El III Encuentro de la Red Andina de Ciudades, el VIII Curso de Justicia Constitucional en colaboración con al Universidad Carlos III, el apoyo a la creación de una Escuela de Magistratura en Brasil, el apoyo a la Agencia Tributaria y a la Reforma Judicial en Argentina, el apoyo a la Administración Tributaria y a la Defensoría Penal en Chile, el apoyo a la Agencia Tributaria en Uruguay, así como los diferentes cursos realizados con el Centro de Estudios Jurídicos sobre: la Gestión del Despacho Judicial, el papel de la investigación criminal y la medicina forense en la consecución de la justicia, el Estado de Derecho y protección de derechos fundamentales y la cooperación Jurídica Internacional; y las actividades realizadas con el Centro de Estudios Políticos y Constitucionales tales como el Foro Latinoamericano de Reforma Constitucional y Administración Territorial, y los cursos de formación a personal técnico de los Parlamentos Latinoamericanos en colaboración con el Congreso de los Diputados y CEDDETT sobre parlamento y estructura territorial, procedimiento y control parlamentario y procedimiento legislativo.

Durante el 2007 cabe destacar el curso realizado en colaboración con el MAEC sobre Operadores de Paz, el apoyo al CLAD para los seminarios de formación y el congreso anual, al igual que en años anteriores, el apoyo prestado por el ministerio del interior durante las elecciones en Guatemala, el apoyo prestado durante el encuentro Centroamérica-Unión Europea realizado en Madrid junto con la SEGIB y el Círculo de Copán, el apoyo a la participación en el Encuentro de Representantes Sindicales para la preparación de la Cumbre de Jefes de Estado y de Gobierno de Santiago de Chile, la X Edición de la Escuela Judicial de Centroamérica y la redacción del Manual de Ética Judicial para América Latina en colaboración con el CGPJ, la colaboración a la preparación del Plan de Acción de las Administraciones Públicas del Programa Regional de Cooperación con Centroamérica y la reunión preparatoria, a celebrar en Madrid a mediados de enero de 2008, del Foro permanente de Naciones Unidas para cuestiones indígenas, así como la participación en la asistencia técnica sobre Responsabilidad Social Corporativa a realizar en Costa Rica; así como la participación de la FIIAPP en el seminario sobre Ayuda humanitaria de Emergencia en Centroamérica realizado en Antigua el 5 y 6 de febrero de 2007.

Igualmente la FIIAPP colabora, por solicitud expresa de diferentes instituciones o países en determinados proyectos como por ejemplo: con el Estado de Mixoacán, Méjico, en el seminario sobre seguridad pública; Con la Fábrica Nacional de Moneda y Timbre en la participación de las III Jornadas Tecnológicas celebradas en Santiago de Chile en octubre 2007; con la Agencia de Protección de Datos en la realización de un seminario en Cartagena de Indicas; con el Ministerio de Justicia en la celebración de la XV Asamblea General de la Asociación Ibero Americana de Ministerios Públicos (AIAMP) en Madrid los días 22 y 23 de octubre y del seminario Iberoamericano “Protección de víctimas y testigos. El Papel del Ministerio Fiscal” celebrado los días 24 y 25 de octubre.

Cabe subrayar igualmente la labor realizada por la FIIAPP para la promoción de un marco estratégico de construcción y modernización de un Estado democrático en Guatemala que consistió en facilitar un escenario de diálogo e intercambio político para los principales partidos políticos y las altas autoridades del Congreso de la República de Guatemala, las autoridades del Poder Ejecutivo encargados de la descentralización y los representantes de los municipios de cara al proceso electoral llevado en Guatemala en noviembre de 2007